미래에, 희망은 있는가. 가면라이더 드라이브는 인류를 멸하는 였다.

시민을 지키기 위해 오늘도 싸움을 계속하는 가면라이더 드라이브(토마리 신노스케). 하지만 그 앞에 토마리 신노스케를 '아버지'라고 부르는 청년이 나타난다. 그의 이름은 토마리 에이지. 미래에서 찾아온 에이지의 목적은 아버지, 토마리 신노스케에게 보내는 경고였다. 2015년 8월 5일, 벨트 씨(드라이브 드라이버)가 폭주해 그것을 계기로 1년 후에는 로이뮤드가 세계를 정복하고 만다는 것이다. 신노스케는 그것을 믿지 못했지만 에이지의 예언대로 드라이브 드라이버에 이상이 발생, 그 대규모의 파괴 행위로 시민의 영웅 가면라이더 드라이브는 전국 지명수배범이 되었다. 크림 스타인벨트의 드라이브 시스템 그 자체가 사실은 인류멸망을 위해 짜인 프로그램이었다는 충격적인 사실과 함께 미래에서 에이지를 쫓아온 넥스트라이도론에 탑승한 수수께끼의 전사 가면라이더 다크 드라이브가 출현! 압도적인 파워에 마하와 체이서는 패배한다. 일찍이 없던 강대한 적, 다가오는 최악의 미래... 여태까지 어떤 때에도 같이 싸워 온 '파트너'는 인류 최대의 위협이 됐다. 남은 길은 단 하나, 자신의 손으로 '파트너'를 처리할 수 밖에 없다. 미래를, 인류를 지키기 위해 결단을 강요받은 신노스케는 결국 그 손으로 드라이브 드라이버를...!